Thuật ngữ trong Bioinformatics (Phần 1)

Cell: là đơn vị chức năng cơ bản nhất của sự sống do nhà khoa học Robert Hooke (18 July 1635 – 3 March 1703, một tiến sĩ trong lĩnh vực tự nhiên) nghĩ ra và sử dụng lần đầu tiên. Nó được xem như là đơn vị chức năng cơ bản nhất của tất cả những sinh vật (organisms) được biết đến đang tồn tại; là đơn vị nhỏ nhất của sự sống. Một số sinh vật, chẳng hạn như hầu hết bacteria, chỉ có một cell (gọi là unicellular). Nhưng đối với một số sinh vật khác, như con người, là những sinh vật chứa nhiều cell (gọi là multicellular). Cơ thể con người có khoản 100 trillion hay 10¹⁴ cells; kích thước thông thường của một cell là 10 µm và một mass của cell thông thường là 1 nanogram. [2]

Metabolic Pathway: là một dãy phản ứng hóa học (series of chemical reactions) xảy ra bên trong cell. Bên trong những dãy phản ứng hóa học này, một hóa chất được vận chuyển vào những chất khác qua một loạt các bước. Những phản ứng này được xúc tác (catalysed) bởi các enzymes và thường sẽ yêu cầu các vitamins và khoáng chất (minerals) để làm việc một cách hợp lý.

Nhà vật lý người Anh, Archibald Garrod, đã thực hiện một trong những nghiên cứu đầu tiên về metabolic pathways vào năm 1909. Ông cho rằng các metabolic pathways quan trọng nhất bên trong cơ thể người là glycolysis (pathway được khám phá đầu tiên), vòng Krebs (Krebs cycle), oxidative phosphorylation and gluconeogenesis. Tập hợp tất cả những pathway bên trong cơ thể người (human body) được gọi là metabolic network, và điều này quyết định những thuộc tính sinh hóa và hoạt động của một cell.

Metabolism: là tập các phản ứng hóa học xảy ra bên trong sinh vật đang tồn tại để duy trì sự sống (Có khác gì với metabolic pathway không nhỉ?). Các quá trình này cho phép sinh vật phát triển (grow) và tái tạo (reproduce), duy trì (maintain) cấu trúc của chúng, và phản ứng (respond) với môi trường xung quanh chúng. Metabolism thường được phân chia thành hai nhóm. Catabolism bẻ gãy (break down) các organic matter (hoặc organic material), ví dụ để thu năng lượng trong cellular respiration. Anabolism sử dụng năng lượng để xây dựng các thành phần của cells như proteins và nucleic acids. The chemical reactions of metabolism are organized into metabolic pathways.

 

[1] http://www.wisegeek.com/what-is-the-metabolic-pathway.htm

[2] http://en.wikipedia.org/wiki/Cell_(biology)